Prisoner
может это в отдельную тему выкинем? вопрос в общем-то достаточно глобальный
у меня в прошлом году с переносом данных между версиями проблем не было. Были проблемы с PHP - кодом
вот
тут - про проблемы с timestamp со ссылкой на
www.opennet.ru.
Цитата:
From version 4.1, TIMESTAMP is returned as a string with the format
'YYYY-MM-DD HH:MM:SS' and different timestamp lengths are no longer supported.
|
ну, собственно, мы с тобой это уже обсуждали, это для "примкнувших к нам" 
ну, а собственно,
документации по изменениям - вагон и маленькая тележка

И даже статья
Upgrading from Version 4.0 to 4.1 пошла читать :/
И на закуску
Upgrading MySQL on Windows