[mwz]

Какая реальная емкость 465,76 гиг или 343 + 157 = 500 гиг как показывает DMDE (см пик 9) ? »

Обе реальные. Первая — с использованием "человеческих" десятичных множителей (1000) для пересчёта объёма байт в гигабайты, вторая — с использованием "компьютерных" двоичных множителей 2^10=1024. Если поставите в DMDE галку "GiB", то она тоже будет показывать объём в "двоичных" гигабайтах (GiB = гибибайт), как это делает Windows.

как сделать единый общий раздел для этого диска? »

Самое надёжное — слить всю информацию с диска на другой диск, затем удалить на этом все разделы, после чего создать новый основной раздел на весь объём винчестера и вернуть информацию на место. Любые другие методы связаны с передвижкой нижней границы существующего диска D: и, соответственно, с ненулевой вероятностью приводят к того же типа проблемам, с которой вы уже столкнулись: "Английские учёные доказали, что Русская рулетка безопасна. На 87,5%".