Этот вариант надёжнее, но он работать у Вас скорее всего не будет: похоже, нет указанных папок, так как dir даже не выходит на Echo для отображения имени папки. Возможно, дело в именах папок: допустим, Вы считаете, что К -русская, а на самом деле -K -латинская. У меня работает с разными уровнями вложенности, ИМХО, это для моего кода не принципиально, лишь бы длина полного имени файла была не слишком большая
Код:

@Echo Off
cls
Set "BoxIn=r:"
Set "MaskIn="*КЖ*.*" "*КМ*.*""
Set "BoxOut=Z:\Box_Out"
Pushd "%BoxIn%\" &&(
FOR /F "usebackq delims=" %%d IN (`2^>nul Dir %MaskIn% /B /S /A:D`) DO (
Echo %%d
>nul xcopy "%%d\*.*" "%BoxOut%%%~pnxd\" /E /Q /Y /R /H /Z /D
)
Popd)
pause
GoTo :Eof
Попробуйте проделать
dir R:\*КЖ* R:\*КМ* /B /S /A:D >D:\txt2.txt
Вы увидите в файле D:\txt2.txt искомые папки?