Громоздко, но работает. И пустые папки убивает.
Лог файл создаётся. Дата в системе должна отображаться дд.мм.гггг
Код:

@Echo Off
Set "DelFile=Z:\Box_In\*.*"
Set /A DeltaDay=-2
Set "LogFile=Z:\Box_Out\%Date:~6,4%%Date:~3,2%%Date:~0,2%_DelFile.log"
Call :FromDate %DeltaDay% %Date% "yyyymmdd"
>>"%LogFile%" (
Echo +++ %Date% %Time% Start Delete Files For Older %DeltaDay% Days
FOR /F "usebackq delims=" %%f IN (`2^>nul Dir "%DelFile%" /S /B /A:-D /O:D /T:W`) DO Call :DateDelFile "%%f" "%%~tf" "%yyyymmdd%"
Call :DelEmpty "%DelFile%"
Echo === %Date% %Time% Stop Delete Files For Older %DeltaDay% Days
)
GoTo :Eof
:DateDelFile
Set "DateFile=%~2"
Set /A DateFile=%DateFile:~6,4%%DateFile:~3,2%%DateFile:~0,2%
If %DateFile% GEQ %~3 GoTo :Eof
Del %1 2>&1 &&Echo --- Deleted %DateFile% %1
GoTo :Eof
:DelEmpty
For /F "Tokens=*" %%A In ('2^>nul Dir "%~dp1" /B /S /A:D ^|Sort /R') Do RD "%%A" 2>nul &&Echo --- Empty Folder Deleted "%%A"
GoTo :Eof
:FromDate
rem Пересчет даты на заданное кол-во дней
rem В первом аргументе +- дни
rem Во втором аргументе дата в формате dd.mm.yyyy
rem В третем аргументе имя переменной в кавычках где получим новую дату в формате yyyymmdd
rem Заимствовано http://forum.oszone.net/thread-186889.html
rem вызов Call :FromNow %DeltaDay% %Date% "yyyymmdd"
rem результат в перемменной %yyyymmdd%
SetLocal
Set "DT=%~2"
Set yyyy=%DT:~-4%& set /a mm=100%DT:~3,2%%%100& set /a dd=100%DT:~,2%%%100
Set /A JD=%~1+dd-32075+1461*(yyyy+4800+(mm-14)/12)/4+367*(mm-2-(mm-14)/12*12)/12-3*((yyyy+4900+(mm-14)/12)/100)/4
Set /A L=JD+68569,N=4*L/146097,L=L-(146097*N+3)/4,I=4000*(L+1)/1461001
Set /A L=L-1461*I/4+31,J=80*L/2447,K=L-2447*J/80,L=J/11
Set /A J=J+2-12*L,I=100*(N-49)+I+L
Set /A yyyy=I,mm=100+J,dd=100+K
EndLocal& Set "%~3=%yyyy%%mm:~-2%%dd:~-2%"
GoTo :Eof