[alpap]

запускать ...»

не есть запустить. Через каждую минуту, час, несколько часов?
Вообще проще и правильнее делать это через планировщик, только в одно время с одними параметрами запуска в другое время с другими или разбить на два отдельных bat и запускать каждый в свое время.