[ArtemD]

msconfig есть в стандартной поставке win98 ($windir\system\msconfig.exe) но никак не в w2k. Под w2k либо ручками править указанные выше пути реестра и файлы автозапуска, либо использовать различные твикеры. Например, Xteq X-Setup(http://www.xteq.com).