Karantin, наблюдается ли проблема в Безопасном режиме работы Mozilla Firefox?
Кроме того, посмотрите это:
I can add or change bookmarks but they are lost when I restart Firefox. Не забудьте перед манипуляциями сделать резервную копию файла профиля или экспорт существующих закладок в файл.