[Vitki]

... например куча всего. Начиная от плохого контакта в разъеме шлейфов до мелких физических неисправностей самогоконтроллера на маме.

... пробило это значит пробило p-n переход ключа. Видели "транзисторы" серии кт315 например, такие маленькие и красненькие. Это называется ключ, а не транзистор. Так вот перед всеми светодиодами на мамах стоят такие ключи, которые их "включают". Только очень маленькие. Это никак не лечится. Как альтернатива - можно подключить лампочку непосредственно к харду. Некотрые модели это предусматривают.

Где форматировался диск - роли не играет.

Если лампочка загорается сразу при включении (или после инициализации конрроллера биосом) - однозначно ось и драйвера не виноваты.
Могу посоветовать только проверить шлейфы, джамреры на ide устройствах (master/slave) и настройки ide в биосе, хотя я никогда не слышал про настройку hdd led.