Самый простой вариант Вставить в начало RunOnceEx.cmd
Код:
if %RunOnceDr%==A goto cont
if not exist a:\RunOnceEx.cmd goto cont
set RunOnceDr=A
start a:\RunOnceEx.cmd
exit
:cont
Тогда перед установкой можно положить на дискету не только winnt.sif но и RunOnceEx.cmd c удаленными или исправленными строками под нужды текущей установки.