bredych,
Вместо KB3038314 для IE9 можно установить последнее обновление, которое его заменяет - KB3124275, вот
прямая ссылка для x86.
Оно перекроет предыдущее обновление и после его установки, ошибки с хранилищем (чексур) по идее должны уйти. Попробуйте.