[Iska]

Вопрос: почему? »

Потому что значение переменной окружения CD вычисляется в момент входа в операторные скобки. Используйте двойное раскрытие:

Код:

call SET INCLUDEPATH=%%CD%%\

Можно использовать и отложенное раскрытие переменных окружения, но это потребует большего кода.