CyMpak
Ну и входи терминально и запускай его из сеанса.
Или из телнета
Добавлено:
Если из своего сеанса - свой сеанс закрывать не надо.
Еще вариант - добейся нужной работы явно указав запуск через cmd (что-то типа "cmd.exe /s batnik.bat"
и потом эту строку запускай как службу (про srvany знаешь?) с любой NT-машины удаленно (через srvmgr или mmc)
