2 веских довода в пользу mod_fcgi (вместо mod_php):
1. Благодаря suexec возможно запускать php-скрипты от имени конкретного пользователя => скрипты не получат доступ к чужим и системным файлам
2. php_mod не работает с Apache в режимах mpm-worker и mpm-event:
https://www.garron.me/en/blog/apache...efork-php.html