Есть множество различных способов создания установочной флешки. Можно через командную строку, через переформатирования флешки в Fat 32 и т.д. Нашел в интернете список из множества вариантов на сайте
http://windowsten.ru/sozdanie-ustano...imi-sposobami/ или можно посмотреть тут:
http://remontka.pro/boot-usb/, в общем погуглите и посмотрите. Вполне возможно что в этом и проблемма. Вот еще видео на youtube:
https://www.youtube.com/watch?v=MQIaJW_Zuzg. Вариантов очень много.
