Код:

findstr /vrc:"^$" file.txt
Или:
Код:

powershell /nop /ex bypass "&{gc file.txt|?{![String]::IsNullOrEmpty($_)}}"
Или ( если есть Cygwin):
Код:

grep -v "^$" file.txt
Или:
Код:

grep '.' file.txt
Или:
Код:

gawk '/./' file.txt
Или:
Код:

sed '/./!d' file.txt