Если не ошибаюсь, то вторым параметром должен передаваться url, а уж после прочие значения, т.е. что-то вроде:
Код:

@echo off
setlocal
set chrome="%programfiles%\Google\Chrome\Application"
set "path=%path%;%chrome%"
chrome google.com -incognito
endlocal
exit /b