[Animal]

1. Поставить W2000 Server от начала на новый сервер со SCSII.
2. Завести в домен и настроить на нем все прожорливые задачи.
3. Сделать дополнательным DC.
4. Назначить "хозяином операций".
5. Если нужно - удалить из домена старый сервер.
Скорее всего придется вносить еще изменения, например в настройки DHCP, DNS.

Еще вариант:
1. То же самое
2. То же самое.
Все. Перенастраивайте клиентов. Старый сервер будет только функции DC и ничего больше. А задачи (если это конечно не какие-то специфические задачи, которые должны быть только на DC) пусть крутятся на новом сервере, не являющимся контролером домена - просто сервере домена.

А как перенести уже установленный сервер на SCSII - это я не знаю, но хотел бы узнать.