Одна exe, другая msi. Со всеми вытекающими. Посему последняя устанавливается в %ProgramFiles%, доступна всем пользователям машины, так же автоматически обновляется (посредством службы, если мне не изменяет память), централизованное развёртывание и управление и т.п.:
Настройка Chrome*for*Work - Cправка - Chrome для бизнеса и образования.
Впрочем, ничто не мешает использовать её не в доменной среде, а на обычной машине. Я всегда именно так и делаю.