[yurfed]

...то есть вы хотите сказать, что я и с NTFS-харда смогу бат-файл прошивочный запустить »

Да, только драйверок для ДОС потребуется.
DOS для NTFS

А тогда зачем мне флэшка? »

Ну грузиться вы как то собираетесь в DOS?