Эхм, вопрос снимается.
Дело в том, что новый винчестер я поделил на основной/активный системный раздел, и на файлохранилище. И судя по всему - при обнаружении нового винчестера система переназначила буквы уже неким своим образом, в результате чего получилось что диском С стал новый логический, а диском F - новый системный (точно помню что в Акронисе все назначал иначе - что подтверждается и тем что система загрузилась хотя бы раз). Что уже при следующей загрузке привело к "биде".