[Begin2Fly]

Aster, есть такой плагин: http://nsis.sourceforge.net/MD5_plugin

Код:

!include logiclib.nsh
OutFile "md5test.exe"
Section ""
	md5dll::GetMD5File "${NSISDIR}\makensis.exe"
	Pop $0
	${If} $0 == 3c49b7e524f015f6c60ba036db5cca8e
		MessageBox MB_OK "Сумма $0 совпадает с 3c49b7e524f015f6c60ba036db5cca8e"
	${ElseIf} $0 == e7b7ae483d017f00c661b1b975e2c883
		MessageBox MB_OK "Сумма $0 совпадает с e7b7ae483d017f00c661b1b975e2c883"
	${Else}
		MessageBox MB_OK "Сумма $0 не совпадает ни с одним из файлов"
	${EndIf}
SectionEnd