anatolii1978, NTFS раздел имеет копию MFT какраз по средине, так что дефрагментировать 4,5 Гб на 8 Гб флешке невозможно. Воспользуйся VBoot, этот маленький образ с соотвествующим меню может запустить фрагментированые образы.
Фрагментация файла, это локальное состояние, оно не переноситься при копировании/перемещении файла. Windows всегда старается записать файл монолитным (дефрагментированным), но не всегда это возможно. Читай
википедию.