[navuhodonosor]

Не совсем понятно, тебе нужно сравнить строчки в принципе (т.е. 1 строка 1 файла = 1 строке 2 файла и тд.) или надо сравнить так (1 строка 1 файла = любой строке 2 файла)?
Ну я не очень силен в разработке, но приходилось большие файлы обрабатывать и сравнивать, правда не такие большие (до 4 ГБ).
Если вариант 1 нужен то по барабану вообще, главное читать построчно.
Если вариант 2, то главное не pascal, я бы например использовал какой-нибудь dictionary и туда загрузил все из первого а потом второй построчно проверял, механизм поиска в словаре довольно быстро работает.