inostranec007, как вариант -- установка утилиты USB Safely Remove (смотрим пункт "Program autorun on device connection\disconnection", или "Автозапуск программ при подключении\отключении устройства" в русской версии сайта).
Для отслеживания подключения и отключения USB-устройств нужна обработка события Windows
WM_DEVICECHANGE. Пример на Delphi приведён на
http://delphiru.ru/winapi/553-hook-usb-device . Думаю что CMD-файл здесь не справится, а вот VB-скрипт должен. Но может знатоки меня и поправят.