Не понял половину. В каком хоть ПО вы создаете этот загрузочник?
p.s.
http://www.microsoftstore.com/store/...l#installation - может поможет? Несмотря на название - W7/WS2008 и на данный момент всё что выше версией пишет нормально. Главное, чтобы разрядность ОС в которой пишете, совпадала с разрядностью ОС которую пишете (на 8.1.1/2012 R2 u1 проверено). Желательно и версии сопоставимой. Сверху вниз версии точно поддерживаются. Обратно не проверял. В UEFI выбираете флешку загрузочной. Вроде всё. По поводу втыкания драйверов в установочный образ - где-то на форуме была куча тем (посмотрите что-нибудь насчет MDT/ADK)