Тут единственное что опасно, это - сам процесс обновления (выключили свет, зацепил провод - в результате чего будет обесточено питание) и совместимость/соответствие прошивки с материнской платой.
А на непредвиденный случай (например появления каких либо глюков из-за обновления), перед обновлением предусмотрено сохранение старого BIOS-а.
Я пользовался утилитой из под DOS. Для сохранения/обновления вводил соответствующие команды, например:
сохранение
Код:

program.exe /save bios.bin
обновление
Код:

program.exe /load bios.bin
естественно это только пример. В реальности в зависимости от производителя материнской платы, команды и название утилит другие. В некоторых материнских платах и вовсе можно обойтись без утилит т.к обновления происходит либо из BIOS либо по нажатию соответствующей клавиши (например из меню выбора загрузки).
Ещё тогда когда обновлял, действовал на свой риск (мог всё таки напортачить чего).
К тому же выбора не было, загрузка с флешки в тот момент срочно нужна была и было всё равно что произойдёт в процессе обновления (помрёт материнская плата или нет).
Потом просто баловался, обновлял BIOS по списку от самого старого до последней актуальной версии и в режиме работы за компьютером тупости компьютера или каких либо непредвиденных глюков не замечал.
Чтоб не заниматься геморроем как я, лучше поинтересуйся
здесь.