Ну вот попробовал сегодня... и проблем вообще не нашел..
Исходное состояние
BOSS_MAIN - Делаем шаблон, делаем экспорт виртуалки в отдельную папку. Удаляем виртуальную машину.
далее.. то что ниже.
читать дальше »
Код:

$ImportPath="D:\Hyper-V\Export_VM\BOSS_MAIN\BOSS_main\Virtual Machines\E55453FE-1382-4786-9717-25BA9C36248A.XML"
$BOSSFolder="D:\Hyper-V\virtualMashine\tmp"
Stop-VM -Name BOSS_1 -TurnOff
Stop-VM -Name BOSS_2 -TurnOff
Remove-VM -Name BOSS_1 -Force
Remove-VM -Name BOSS_2 -Force
del $BOSSFolder\BOSS_1 -Recurse -Force
del $BOSSFolder\BOSS_2 -Recurse -Force
Import-VM -Path $ImportPath -copy -VhdDestinationPath $BOSSFolder\BOSS_1\hdd -GenerateNewId -SnapshotFilePath $BOSSFolder\BOSS_1\Snapshots -VirtualMachinePath $BOSSFolder\BOSS_1
Rename-VM -Name BOSS_MAIN -NewName BOSS_1
Import-VM -Path $ImportPath -copy -VhdDestinationPath $BOSSFolder\BOSS_2\hdd -GenerateNewId -SnapshotFilePath $BOSSFolder\BOSS_2\Snapshots -VirtualMachinePath $BOSSFolder\BOSS_2
Rename-VM -Name BOSS_MAIN -NewName BOSS_2