Можно сколько угодно Хр-шек или других ОС скормить скрипту, а затем закинуть готовые образы на флешку. Так же скрипт можно обработать несколько ОС в одном образе, единственное условие для Хр/2003, это наличие prodspec.ini по которому он ориентируется. Или может тебе нужно -
Совмещение нескольких вариантов установки Windows XP на одном диске ?