[Shpionus]

Не получатся может именно из-за того что SetupComplete.cmd отрабатывает ДО первого входа в систему, и соответственно до создания учётной записи пользователя. Через SetupComplete.cmd можно запланировать запуск вашего framework 4.5 после первого входа в систему. Но естественно этот самый framework 4.5 должен быть предварительно подготовлен для АВТОМАТИЧЕСКОЙ установки, без участия пользователя.
Как именно у вас не получается? Не хочет проходить процесс установки? Или даже запуска не происходит? Попробуйте для начала запланировать именно что-то простое, то что железно сработает само по себе, чтобы убедится что вы правильно работаете с SetupComplete.cmd
Я пока что не понимаю на каком этапе у вас не получается, а потому и подсказать пока не знаю что.