nikson89, думаем дальше.
Раздел реестра
HKCU\Software\Classes хранится в кусте
профиль учетной записи\AppData\Local\Microsoft\Windows\UsrClass.dat
Что-нибудь в журнале по поводу
UsrClass.dat есть? Например, не загружается при входе или не сохраняется при выходе?
Попробуйте рекомендации
Как определить, является проблема системной или вызвана сторонним приложением/службой