На хабре описывалась подобная проблема с WD
http://habrahabr.ru/post/106273/
правда там другая модель и Линукс...
Но принцип тот же. Смысл сводится к тому, что надо связываться с саппортом WD и получать полуофициальную утилиту для регулирования времени парковки головок.
В целом чего-то инженеры WD перемудрили и похоже эта фича (бага?) будет кочевать из модели в модель еще долго. Можно слить информацию с диска и попробовать сдать диск продавцу и взять (пусть с доплатой) диск другого производителя.