[MKN]

kpripper,
Если в файле djvu - OCR слой, то редактировать текст-колонки можно в любом djvu редакторе, типа Lizardtech DjVu Document Express Editor Pro
А лучше текст скопировать в Word (желательно в 2007) и с помощью соответствующих макросов объединить колонки. Вряд ли такие средства есть в djvu редакторах, а без этого возиться придётся долго... Ну и сделать из результата - djvu :

Либо в djvu редакторе (возможно, после конвертирования doc в удобоваримый для редактора, формат). Но это не удобный вариант.
Или другой вариант - с помощью виртуального DjVu-принтера.
Или, что ещё удобней - с помощью Office 2007 DjVu Exporter.

Если в файле djvu - графика, то сначала придётся распознать текст (лучше ABBYY FineReader_ом) и далее проделать вышеназванные операции.