Скорей всего чем то разбилась на 2 раздела.
Выполняем следующее:
Win+R -> cmd
Код:
diskpart
- Откроется новое окно, далее там.
Код:
list disk
select disk # (вместо # номер диска, что по размеру подходит вашей флешке)
clean
create partition primary
format fs=ntfs quick
active
assign
Должно вылезти окошко о том что новый диск подключен, смотрим размер, результаты сюда.