convert.exe - команда операционной системы для конвертации файловой системы FAT в NTFS, лежит в папке \Windows\system32. Ваш convert.exe явно делает что-то другое. Указывайте путь к EXE-файлу:
Код:

@echo off
путь_к_утилите\convert.exe "%~1" "%~dpn1.png"
Если convert.exe в той же папке, что и батник:
Код:

@echo off
"%~dp0convert.exe" "%~1" "%~dpn1.png"