Эм, давайте сначала на все компьютеры сети поставим обновления, а затем уже начнем. Думать дальше. При этом обновления надо ставить не только на систему но и на софт. Java. Flash и тд. Если на каких-то компах не нужна ни Java ни Flash - то удаляйте.
Отключите автозапуск с флешек и с жестких дисков.
Ознакомьтесь с этой
статьей
Подготовьте еще такие логи, может что увидим:
Раз
Два