[art.andr]

Идей по этому поводу как я понял ни у кого нет
Решил проблему тем, что в планировщике вместо запуска .bat файла указал напрямую запуск программы с необходимыми параметрами. Все работает, все довольны, но вопрос все же остался открытым: почему планировщик так и не может запустить программу с .bat файла