Чем больше мелких файлов - тем выше фрагментация. У дисков может отличаться размер кластера - это тоже сильно влияет на фрагментацию. Так-же влияет то, какими темпами заполнялся диск информацией - если за короткий промежуток времени - фрагментация меньше, а если за длительное время - увеличивается. Еще влияет то, как часто с диска удаляется или перемещается информация, ну и напоследок - у некоторых ноутбуков процесс дефрагментации проходит автоматически в фоновом режиме - что снижает количество фрагментов.
Как видите - причин много
