[Delirium]

Ну из этого ничего толком не выловишь...
Запускаем profiler, травим его на свою базу, мониторим обращения программ и особо внимательно смотрим на время отклика. Выкладываем результаты.

Здесь может быть несколько проблем - от неверно настроенной сети на сервере до "железных косяков". Надо больше информации для анализа.