THUN, все перечисленные в CheckSUR.log поврежденные файлы относятся к Windows Update Agent 7.6.7600.256. Как его переустановить, неизвестно (старые версии Windows Update Agent имели standalone установщик, но для текущей 7.6.7600.256 его не существует).
Агент обновился недавно (в течение двух недель), так что можете сделать
откат на точку восстановления и попробовать еще раз.
Или придется копировать указанные файлы с нормально работающей системы.