[K.A.V.]

Подожду K.A.V'a, может быть он что-нибудь сообразит »

Я, честно говоря, не понял суть задачи
Вам нужно, чтобы при отметке отдельной секции (в примере "Независящая секция") не отмечалась секция в группе или что?

Во вторых - может кто знает, как написать плагин для nsis на визуал бейсике .net. »

Сомневаюсь, что здесь вам кто-то подскажет насчет написания плагинов на данном языке (разве что kotkovets может быть)
В основном же, плагины к NSIS написаны на С++ (ну а там впринципе ничего сложного для С программиста), возьмите поскачивайте плагины со странички http://nsis.sourceforge.net/Category:Plugins
Возможно, какой-либо плагин и написан на нужном вам языке, практически все плагины с исходниками
Либо задайте вопрос на англоязычном форуме в разделе NSIS