Anton04,
Стоит уточнить, что MST это не файл ответа для msi, a трансформ.
Вот, что об этом думает Microsoft->
msdn.
Зря вы обиднли
InstEd, это как раз его прямое назначение - редактирование MSI, как напрямую, так и через трансформ.
Да, он не имеет визардов, очень многое, если не все, вам прийдется делать руками, но я сомневаюсь, что вы найдете бесплатный аналог InstallTailor.
Последнии версии InstEd поддерживают импорт записей из reg и ini файлов.
