Выложите значение параметра BootExecute в разделе реестра
HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager
и содержимое (при наличии) ветки
HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\PendingFileRenameOperations
Приведите размеры файлов в папке \Windows\System32\config