CyraxZ, дело в том, что Вы
когда-то во втором разделе установили формат номера страницы таким вот образом: «Нумерация страниц — начинать с: 2».
Теперь, несмотря на то, что нынче этот раздел не имеет видимого колонтитула с номером страницы, эти настройки существуют и являются действующими. Отсюда — номер первой страницы третьего раздела равен «3».
Можно вернуть вобрат нумерацию второго раздела к стандартному виду, выполнив в окне «Immediate» («Ctrl-G») редактора VBA команду:
Код:

ThisDocument.Sections.Item(2).Headers.Item(wdHeaderFooterPrimary).PageNumbers.RestartNumberingAtSection = False