Dzutte,
win7 x64, win7 x86, win server 2008 - таким способом может быть закинута на флешку только в единственном экземпляре (что то одно из перечисленного вами)
Файл menu.lst, который получился после всех операций - просто копируется на флешку при выполнении пункта 5 (независимо от того что было добавлено на флешку ранее)
Наиболее простой вариант запускать установку win7 x64, win7 x86, win server 2008 из ИСО
Для флешки -
http://greenflash.su/_fr/7/9357506.zip
Для USB-HDD -
http://greenflash.su/_fr/6/9745575.exe