wine не предусматривает использование одного WINEPREFIX несколькими пользователями...
Однако, можно выкрутится таким способом - завести отдельного пользователя, можно беспарольного, дать соответствующие права в sudoers нужным реальным пользователям и запускать программы примерно так:
Код:
sudo -u windows -H wine regedit
