[avv]

Два года назад я здесь пытался выяснить аналогичный вопрос (он выше по треду). Могу сказать, что не следует переусложнять поиски: никакие вопросы разбиения дисков или содержания загрузочных секторов отношения к проблеме не имеют. Все намного проще. Влияет не только установленность программ или наличие системных файлов на другом томе, но и наличие в системе ярлыков на другой том. Например, на рабочем столе.
Самый простой способ, которым пользуюсь я состоит в том, чтобы непосредственно перед бекапом отобрать букву у этого тома. Естественно, что это никак не влияет на информацию, хранящуюся на томе. Сразу после завершения бекапа букву можно восстановить. Два года пользуюсь этой методикой ...