TROY Diamond,
идеальный для тебя вариант (сам использую)
скопируй куда нибудь в конец секции CODE
http://rghost.ru/36227252
если не были созданы файлы после установки в директории установки, то удалит всё
если были созданы, то после удаления основных файлов появится окно со списком созданных после работы приложения файлов и галками можешь удалять отдельные ветки или некоторые файлы
скрин-пример
http://rghost.ru/36227488
не забудь испольвоать в секции удаления такую строку
[UninstallDelete]
Type:
files; Name: {app}
это часть Inno Setup Upgrade от Виктора Дробова
