[vadblm]

Управлять поведением вентиляторов с ШИМ в линуксе можно при помощи fancontrol из пакета lm-sensors.
Температура, при которой включаться/выключаться, температура, при которой развивать максимальные обороты, интервал опроса датчика. Статей по настройке lm-sensors/fancontrol - море, пересказывать их не буду, найдёте сами. Скажу лишь, будьте аккуратны при настройке - слишком оптимистичные значения MINSTART/MINTEMP/MAXTEMP могут вызвать перегрев железа, слишком пессимистичные - создадут излишний шум. С INTERVAL та же история - слишком большой интервал грозит потенциальным перегревом, слишком маленький - волнообразными завываниями.