Все утилиты типа shred работают одинаково - переписывают файл лабудой перед удалением. Разница только в способе, как генерируется лабуда и в количестве пассов. Если есть опасения, что данные или их часть уцелеет после такой стирки, за счёт журнала данных, избыточности RAID или ещё каких особенностей ФС, то ни одна из них не даст гарантии - абсолютным параноикам следует стирать блочное устройство напрямую, кстати, для пущей надёжности это можно делать с помощью тех же шредоподобных утилит.
Или вообще уничтожать его как Терминатора в расплаве, кстати, без шуток, списываемые носители в госструктурах США проходят подобную процедуру.
Впрочем, если есть желание, можете посмотреть, помимо shred и wipe, эти утилиты:
srm
secure-delete (пакет содержит помимо вышеупомянутого srm также утилиты для чистки памяти, свопа и свободного места)
scrub
Ну и разумеется, великий и ужасный dd, только всё же стирать лучше не нулями, а /dev/random.
