[kotkovets]

например при S/port распаковывалась портативная версия »

Все достаточно просто, условие портативной установки, если $Radio = 1, а если в тихом режиме
устанавливать значение $Radio = 1, то условие распаковки будет выполнено..
и заодно парсить командную строку инсталлятора
Читайте в оригинальной справке - поиск по индексу GetOptions

читать дальше »

Код:

!include "MUI2.nsh"
!include "FileFunc.nsh"

!insertmacro MUI_PAGE_INSTFILES
!insertmacro MUI_LANGUAGE "Russian"
OutFile "test.exe"

var Radio
var Radio1

Function .OnInit
  ClearErrors
  ${GetOptions} "$CMDLINE" "/port" $R0
  ${If} ${Silent} ;если тихий режим
     ${IfNot} ${Errors}
       ;здесь будет код выполняться с ключом /port в тихом режиме
        StrCpy $Radio1 1 ;распаковка портативной версии
        StrCpy $Radio 0 ;запрет установки в обычном режиме
     ${Else}
        ;здесь будет код выполняться в тихом режиме без ключей (по умолчанию)
        StrCpy $Radio1 0 ;запрет портативной версии
        StrCpy $Radio 1 ;установка в обычном режиме
     ${EndIf}
  ${Else}
     ClearErrors
  ${EndIf}
FunctionEnd

Section ""
 ${If} $Radio == 1
      MessageBox MB_OK "Обычная установка в тихую" IDOK
 ${ElseIf} $Radio1 == 1
      MessageBox MB_OK "Портативка установка в тихую" IDOK
 ${Else}
   MessageBox MB_OK "Обычная установка" IDOK
 ${EndIf}
SectionEnd

а что поправить для совместимости с реестром 64 »

В данный момент у меня нет под рукой х64, читайте выше мои сообщения.
Если программа 64-битная, то следовательно ей нужен доступ к 64-разрядному виду реестра,
что достигается командой SetRegView 64 - смотрите справки,
а также редирект на папки 64-битных программ - смотрите хедер х64.nsh